PEAKS AB 3.5 测序解决方案 peaks AB自动化工作流程060559

2024-03-30 5,320

PEAKS AB是领先的测序解决方案060559,提供强大的工具集,提供精准的图形化结果,自动化工作流程和自动化优势以及详细的报告,通过简单的操作提高用户的技能水平,最终您还可以获得详细的报告,基于高精度液相-质谱数据集,全自动从头测序,准确分析,全新版本提供强大的先进的算法,全面升级,整合能力。 PEAKS AB 3.5 彻底改变了蛋白从头抗体测序,具有更高的准确性、精细的 PTM(翻译后修饰)表征和先进的聚糖分析。主要特点包括预测同量异位残基的保留时间、改进的完整质量数去卷积和增强 Ile/Leu 分化。PEAKS AB 3.5 支持 timsTOF 数据、升级的用户界面和扩展的定制功能,为抗体测序工作流程树立了新标准。

功能特色

1、软件概览

从抗体的肽段de novo测序结果得到抗体蛋白序列。 这些可靠的从头测序序列标签是来源于碎片离子的直接证据,进而组装为抗体序列。可通过点击肽段查看谱图,并且直接在谱图上标注碎片离子对应的每一个氨基酸。

2、PEAKS AB: 提供综合的肽图结果,包括:

1. 全序列信息整合视图

2.显示每一个氨基酸来自碎片离子的直接 证据

3.翻译后修饰及位点信息(PTMs)

4.氨基酸替换(序列突变确证)

3、对于含有修饰位点的每一条序列,在定量结果视图中,都列出了它们的修饰形式和未修饰形式,及其相应的色谱图,提供基于XIC的定量信息。

4、序列突变视图对于可能是由互补DNA的转录错误产生的氨基酸变异和/或截短的结果部分予以高亮显示。

5、在强化的peptide mapping功能中,PEAKS AB软件可以比较、注释不同样品的色谱图。软件中阐明可能发生的序列突变,以便于产品质量控制或任何其他相关的抗体研究。

带有注释的色谱图中蓝色的峰表示信号映射到来自参考蛋白质的肽段,而红色的峰表示序列突变或任意与产品相关的杂质。

6、PEAKS AB不仅能支持EThcD碎裂模型,而且还能将不同碎裂类型的同一个母离子的MS2谱图结合起来进行从头测序,从而得到更可靠的从头测序结果。

7、算法

PEAKS AB软件可以利用正交设计的多酶联合酶解的抗体蛋白,通过高分辨率LC-MS/MS获得的数据集,直接对抗体蛋白进行序列分析。该方法首先进行肽段的de novo sequencing,并将可信度高的序列标签自动组装成抗体序列。

8、报告生成

抗体样品描述,缩略词说明,实验流程,抗体轻/重链信息,氨基酸序列,通过肽谱匹配水平0.1% FDR质控的peptide mapping,可变区典型肽段的选择,区分Ile/Leu。

PEAKS AB 3.5 测序解决方案 peaks AB自动化工作流程060559

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PEAKS AB 3.5 激活版

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